Tras unas temporadas convulsas, la entidad vasca regresó a la Segunda División el 1 de junio de 2013, venciendo en el partido de vuelta de la eliminatoria de ascenso al Real Jaén Club de Fútbol por 1-0, camisetas fútbol baratas con gol de Viguera de penalti y tras cosechar un empate a un gol en el de ida disputado en el estadio de La Victoria. Con Juan Arregui Garay como presidente, y tras la disputa durante cinco temporadas consecutivas de los «play off «por el ascenso a la Segunda división, lo logró en Jaén el 21 de junio de 1995, comandado por Jesús Aranguren, pese a perder 3-1. Tres años más tarde, el 3 de mayo de 1998, y tras batir el récord de puntos de la Segunda División española (82) logró el ascenso a la Primera División en Mendizorroza ante el Rayo Vallecano. Con varios cambios de técnico, que terminaron con Alberto López como entrenador del primer equipo se logró la permanencia en la categoría de plata en la temporada 2013/2014 en los últimos minutos de la última jornada en un épico partido frente al Real Jaén con gol de Guzmán Casaseca. Los días de partido de Copa y Liga, el museo solo puede visitarse hasta 3 horas antes del partido.
No obstante, esa temporada el conjunto albiazul pudo disputar la Copa de 1939, venciendo en octavos al Bilbao Athletic, al Racing de Santander en cuartos, pero cayendo frente al Sevilla C.F. Abriéndose así un nuevo periodo para el conjunto vitoriano, en el que una vez eliminada la deuda el próximo paso que el club se propuso fue el confeccionar una plantilla que le hiciera regresar a la Primera División. Tras varios años intentando solucionar el tema de la deuda que el conjunto vitoriano arrastraba desde la salida de Dmitry Piterman del club en el año 2007, a principios de verano del 2015 el club salió del concurso de acreedores poniendo fin a esa etapa «negra» en el seno del club. La entidad arrastraba graves problemas económicos debidos a la mala gestión de Dmitry Piterman, por lo que el club entró en concurso de acreedores, lo que acarreó una intervención judicial. El Alavés en 2001 era el equipo que más goles ha conseguido en una temporada en la historia de la Copa de la UEFA con 36, además es el primer equipo en jugar una final de la UEFA en el año de su debut. Su buena temporada le hizo conseguir matemáticamente la permanencia en Primera a siete jornadas del final.
Una situación que no impidió, sin embargo, encadenar la mejor racha en lo deportivo, consiguiendo tres jornadas consecutivas sin perder. Por su parte, el 29 de julio, el Ministerio de Industria prohibió al canal iniciar transmisiones, alegando que Radio Televisión Madrid había tenido plazo para solicitar una licencia de televisión adicional hasta el 15 de junio pasado, fecha en que se aprobó una ley para incentivar la emisión por TDT. ↑ El canal de televisión Intereconomía, del grupo de comunicación del ex diputado popular Julio Ariza, emitió el pasado domingo un documental para reivindicar la memoria del Caudillo en vísperas del 20-N. Archivado el 5 de julio de 2009 en Wayback Machine. 19- C.S. 21 de Julio Cantón de Belén 20- C.S. ↑ «Las cifras de los tres años de mandato de Sandro Rosell». El Club en cifras Datos sobre el club en la página web oficial. Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Selección de fútbol de Corea del Norte.
Sin embargo, pese a los numerosos ilustres jugadores que pasaron en la época por el club, uno sobresalió entre el resto por su enorme carisma y gran capacidad goleadora y que años más tarde terminó por ser una de las mayores figuras de la entidad: Santiago Bernabéu. La temporada 2010/11, año del XC Aniversario del club, tras un arranque de liga inmejorable con 8 partidos invicto, el Alavés se proclamó campeón de invierno de su grupo, siendo además el equipo más goleador de toda la Segunda División B, sin embargo, la buena racha se truncó a mitad de la segunda vuelta, clasificándose finalmente en la 3.ª posición. En marzo de 2019, tuvieron unos malos partidos amistosos contra Estados Unidos (1-0) y contra Honduras (0-0). En junio tuvo dos amistosos previos a la Copa América 2019 realizada en Brasil donde igualó 1-1 con Venezuela y después fue derrotado por 3-2 ante México, ambos juegos fueron en Estados Unidos. Buena parte de ese mérito correspondió a su portero Martín Herrera, quien ganó el Trofeo Zamora al encajar 37 goles en 38 partidos.